Le FC Bavois se compose actuellement des équipes suivantes :

Première équipe (1ère ligue Promotion)
Deuxième équipe (2ème ligue)
Troisième équipe (4ème ligue)
Séniors (Champion)
Vétérans
Equipes juniors

Le FC Bavois fait partie du Movement Juniors Orbe et Régions aux côtés des clubs d’Arnex, Baulmes, Champvent, Chavornay, Croy, Ependes, Montcherand, Orbe, Rances, Suchy et Vaulion.